In diesem einzigartigen Naturparadies wurden bislang mindestens 4.700 Arten registriert, inklusive Pflanzen und Wirbeltieren. Bis heute wurden in etwa 670 verschiedene Vogelarten im Pantanal identifiziert - eine Anzahl, die die Artenvielfalt in Europa übersteigt.
Das vorherrschende Klima in dieser Region ist vorwiegend heiß und feucht mit durchschnittlich 32°C im Sommer und 21°C im trockenen, kühlen Winter. Das Klima im Pantanal kann in 4 Jahreszeiten gegliedert werden:
- Trockenheit: Juni bis September
- Steigende Überschwemmung: Oktober bis Dezember
- Höchster Überschwemmungsstand: Januar bis März
- Abfluss: April bis Mai
Gerade die jährlichen Überschwemmungen sind von größter Bedeutung für das Gedeihen der Tier- und Pflanzenwelt. Der Rio Paraguay hat auf seinem 600 Kilometer langem Weg durch die Tiefebene des Pantanals nur ein Gefälle von 30 Metern. Aufgrund dessen werden während der Regenzeit zwei Drittel des Gebietes überschwemmt und metertief unter Wasser gesetzt. In diesen Monaten ziehen sich die Tiere in die Trockenwälder und auf die Uferdämme der Flüsse zurück.