Die Anmeldung bei Signal erfolgt mit der eigenen Mobilfunknummer. Es seien dem Open Whisper Systems Gründer Moxie Marlinspike zufolge keine Passwörter, PIN-Nummer oder ähnliches als Login notwendig. Die Kommunikation wird mit einer Ende-zu-Ende-Verschlüsselung abgesichert. Wie Marlinspike im Blog seiner Firma schreibt, sei die Entwicklung der App sehr genau erfolgt verbunden mit dem Ziel eine sichere Kommunikation für die Nutzer zu etablieren.
Der Messenger erfüllt die strengen Anforderungen der US-Bürgerrechtsgruppe Electronic Frontier Foundation (EFF). Alle Nachrichten und Telefonate, die mit Signal geführt werden lassen sich aufgrund der Verschlüsselung noch nicht mal vom Provider lesen und bedeutet höchste Sicherheit für den Anwender. Ein bekannter Anwender von Signal ist der Whistleblower Edward Snowden, der die Messaging-App eigenen Angaben nach jeden Tag nutzt.